Ben is eigenaar van een bioscoop en woont samen met zijn vriendin Miko. Zij werkt voor een filmfestival en is politiek actief, maar deelt haar ideologie niet met hem. Zijn beste vriendin Alice is lesbisch en stelt Ben als haar vriendje voor aan haar conservatieve familie. Wanneer Miko naar New York vertrekt in het kader van een stage, is Ben op zichzelf aangewezen.

Een getrouwd koppel uit de Verenigde Staten trekt naar Spanje om het jaarlijkse San Sebastián filmfestival bij te wonen. Daar aanwezig zijn beiden in de ban van de festiviteiten en het stadje. Terwijl de echtgenote een band schept met een Franse regisseur raakt haar wederhelft gecharmeerd door een Spaanse senorita.

'Clapboard Jungle' volgt gedurende vijf jaar het leven en werk van de onafhankelijke filmmaker Justin McConnell. Er wordt een blik geworpen op de moeilijkheden van de financiering van een film alsmede de zoektocht naar de juiste samenwerkingen en de werking van de distributie. Oude rotten uit het vak zoals Guillermo del Toro, Paul Schrader, Dick Miller, Mick Garris en Tom Holland vertellen over hun ervaringen. Ook delen ze tips om het te kunnen maken of overleven in deze low-budget filmindustrie waarin tegenwoordig iedereen een film kan maken, maar amper iemand hiervan kan leven.