Mr. Popper is een machtige New Yorkse zakenman die alles doet voor de zaak, maar weinig voor zijn familie. Maar op een dag wordt Tom Poppers leven op z'n kop gezet wanneer hij plotseling zes pinguïns erft. Het is niet makkelijk om voor de dieren te zorgen, maar gaandeweg gaat het steeds beter en leert hij ook het belang van familie en vrienden kennen. Maar kan hij de balans vinden tussen zijn privé- en zakenleven?